Master 2

Tronc commun (10 ECTS)

Actualités et avancées récentes en sciences du médicament et des produits de santé

Responsable : Pr Pierre-Antoine Bonnet

Objectifs :

Cette UE est une UE de Tronc commun du Master 2 qui vise à acquérir une vision transversale en Sciences du médicament et produits de santé. Les interventions couvrent des domaines très variés dans le cadre d’un ou plusieurs parcours du Master Sciences du Médicament et Produits de Santé

Description :

Les interventions, essentiellement sous forme de conférences, sont effectuées par des scientifiques, professionnels du secteur privé ou public, particulièrement impliqués dans des domaines structurant ou émergeant en santé.
Chaque intervention est effectuée de façon à situer dans un premier temps le contexte de celle-ci et son importance en santé. Les interventions peuvent être effectuées en anglais et si besoin, sous forme de visioconférences.
Chaque intervention est suivi d’un temps d’échange et de questions/réponses avec le conférencier.
L’UE comprends une journée de conférences orientées vers la Qualité dans l’industrie pharmaceutique. Cette journée est organisée dans le cadre d’un partenariat avec Sanofi.

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Management de projets et management du risque

Responsable : Dr Franck Diafouka

Objectifs :

Understand the key elements which contribute to successful management of Projects, with examples in close relation with the management of Medicines and Health Products

Description :

The course includes 20 hours to gain knowledge and build competence around the following key aspects:

  • Definition of Projects and Project Management
  • Project Leadership
  • Project Complexity
  • Project Environment and Stakeholders Management
  • Management of Project operations, teams and individuals
  • Problem formulation and decision-making, including governance in the context of Projects
  • Project Risks and Crisis Management

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Communication – Application de l’anglais à l’évaluation des produits de santé

Responsables : Isabelle Maitre Devallon, Audrey De Ceglie

Objectifs :

Développer les compétences de communication (compréhension et expression orales et écrites) en langue anglaise dans le cadre de l’environnement professionnel (sciences/santé).

Les étudiants seront, entre autres, amenés à utiliser et développer les compétences suivantes :

  • argumenter, synthétiser, organiser ses idées, défendre un point de vue (oral/écrit)
  • Prendre la parole en public, gérer les échanges et ses émotions
  • interagir à l’oral avec les autres, concevoir des supports (diapos), présenter à l’oral
  • Rédiger des documents professionnels, lire des documents scientifiques

Description :

Même si l’ensemble des compétences de communication pourra être abordé, l’accent sera particulièrement mis sur la communication orale, par exemple :

  • Simulation de réunions professionnelles
  • Jeux de rôles et mise en situation (dialogues)
  • Jeux d’équipe et jeux coopératifs
  • Présentations orales en anglais
  • Rédactions diverses
  • Etude de documents audio, vidéo et textes en Anglais

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UE spécifiques (20 ECTS)

Bioinformatique structurale

Responsable : Dr Stefano Trapani

Objectifs :

Apprendre les méthodes et outils pour :

  • l’analyse comparative de séquences et structures 3D des macromolécules biomolécules
  • la prédiction de leur structure tertiaire.

Description

La connaissance de la structure 3D de bio-molécules isolées ou en complexe avec d’autres partenaires moléculaires (substrats, inhibiteurs, cofacteurs, récepteurs…) est une source précieuse d’informations pour l’élucidation des mécanismes du vivant au niveau moléculaire. Ce type d’information (qu’on peut obtenir par des techniques expérimentales telles que la cristallographie ou la RMN) peut être utilement analysé par des moyens informatiques. Elle est couramment exploitée, par exemple, dans l’industrie pharmaceutique pour guider la conception de nouveaux composés à but thérapeutique (modélisation de ligands assistée par ordinateur). De même, l’analyse comparative du grand nombre de structures et séquences actuellement disponibles dans les bases de données publiques permet de réaliser avec de plus en plus de fiabilité des prédictions statistiques sur des biomolécules pour lesquelles l’information expérimentale sur leurs structures n’est pas disponible.

  • Alignements de séquences et structures.
  • Modélisation moléculaire. Principes de la modélisation par homologie des structures protéiques.
  • Criblage de ligandsin silico.

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Biocristallographie : structure et criblage de protéines

Responsable : Pr Jean-François Guichou

Objectifs :

  • Apprentissage des étapes permettant de déterminer la structure 3D à haute résolution de macromolécules biologiques et de complexes cristallisés.
  • Apprentissage du criblage par cristallographie et du Structure Based Drug design.
  • Présentation des différents aspects abordés en Cristallographie des protéines par des intervenants professionnels venant du milieu industriel sous forme de conférences.

Description

  • Contrôle des échantillons pour la cristallogénèse
  • Cristallogénèse :
    • Fondements, techniques
    • Criblage, affinements des conditions de cristallisation
  • Cristallographie :
    • Réseau cristallin, réseau réciproque, symétrie cristalline et diffraction
    • Enregistrement et analyse des données de diffraction
    • Le phasage et les cartes de densité électronique
    • La construction, affinement et validation des modèles
    • Diffraction in situ et criblage à moyen débit
  • Criblage par cristallographie sur des protéines thérapeutiques
  • Fragment based drug design

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Biochimie préparative et analytique

Responsable : Pr Stéphane Delbecq

Objectifs :

  • Acquisition des techniques modernes de biologie moléculaire pour l’expression, la purification et la caractérisation de protéines recombinantes.
  • Acquisition des techniques d’analyse des interactions protéines / ligands (Techniques de Fluorescence, de Résonance Plasmonique…)

Description

Production de protéines recombinantes :

  • Techniques d’expression bactérienne et de purification des protéines recombinantes.
  • Marquage (isotopiques ou chimiques, uniformes ou sélectifs)
  • Techniques d’expression « cell-free »
  • Caractérisation structurale (TSA, Dichroïsme Circulaire, RMN…)

Analyse des Interactions Protéines/Ligands (2,5 ECTS) :

  • Techniques de fluorescence (Polarisation de Fluorescence,…)
  • Résonance Plasmonique de Surface.

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RMN biologique : structure, interactions et criblage de molécules bioactives

Responsable : Pr Christian Roumestand

Objectifs :

  • Etude de la structure, la dynamique et des Interaction des biomolécules avec leurs ligands pharmacologiques par les techniques de RMN.
  • Présentation, sous forme de conférences, par des intervenants professionnels des applications, des contraintes de la RMN en milieu industriel.

Description

  • RMN : phénomène physique
  • RMN 1H et 13C
  • La RMN homo- et hétéronucléaire 2D et 3D appliquée à l’étude structurale des protéines.
  • Les stratégies d’attribution des spectres de molécules complexes :
    • Attribution de spectres de peptides et protéines
    • Attribution des spectres d’Acides Nucléiques
    • Attribution de spectres d’oligosaccharides
  • Le traitement des données de RMN : du spectre à la structure 3D
  • Dynamique des protéines et RMN
  • Criblage de fragments par RMN

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Drug design: case studies

Responsable : Dr Ludovic Maillard

Objectifs :

  • Mettre en perspective et consolider les acquis théoriques abordés dans les différentes UE traitant de la conception du médicament en Master 1 et en Master 2.

Description :

  • Etude bibliographique encadrée  par petits groupes sur un cas concret de molécule active. La restitution des travaux se fera aux travers de présentations orales et d’un rapport écrit final.

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Semestre 4

STAGE

Un stage de cinq mois minimum devra être effectué dans un laboratoire de recherche (académique ou privé) à partir du mois de mars.

Responsables : Pr Jean-François Guichou / Pr Christian Roumestand

Description :

Au cours d’un stage pratique de 4-5 semaines, l’étudiant se perfectionnera dans l’une ou l’autre des techniques enseignées dans les UE inscrites au Parcours Biologie Structurale et Conception Rationnelle de Molécules Bioactives. Ce projet comprend une partie étude bibliographique sur un thème proposé par l’enseignant et une partie pratique qui se déroulera dans un laboratoire de recherche habilité ou l’étudiant sera encadré par des chercheurs.

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